Зато трамваи едут :)

Да, интересная тут конфигурация.

Трамвай строился с заделом под запуск скоростного.

Причём лет 15 назад я на каком-то сайте встречал информацию, что в центре Ярославля даже планировали подземные станции строить...

Да, отказались из-за подземных рек под центром города.

Если речь идёт об уровне котлована (глубина от поверхности где-нибудь 5-6 метров) то перенести, перенаправить подземные ручи, ливнёвку и различные коммуникации - проблема решаемая, причём не за такие уж баснословные средства. Основная проблема была каждый раз в руководстве, не желающем связываться с такими сложностями ради трамвая. Впервые речь о подземном скоростном участке под центром шла ещё в середине 60-х годов, идею зарубил лично Лощенков (момент описан в книге у Ковалёва).