Насколько я понял, теперь всех пассажиров высаживают на музее археологии

Формально их всегда там и высаживали.

Можно было доехать до Комсомольской площади если ты сел до музея археологии

Сколько помню единицу водители всегда отстраивались/пропускали друг друга/вставали в график именно на музее археологии. Собственно, это легко подтвердить по численности фотографий из галереей города с этой точки. И в общем то Комсомольская площадь была как бы "первой остановкой", а не конечной.