Трамвайно-железнодорожных пересечений,существовавших в один период времени,вспоминаю только три:
Ахангаранское шоссе(пересечение с подъездным путём на ЛИС).
Пересечение возле бывшего 1 трамвайного депо(путь на площадку разгрузки новых трамвайных вагонов).
Пересечение с подъездным путём к ТашИИТ.

Ещё было пересечение жд ветки на текстилькомбинат и к жби - на ул. Кушбеги с 9 маршрутом трамвая 2011-2016 и с 14 маршрутом троллейбуса на ул. Бабура пока не убрали 14 с Аэропорта в начале нулевых.

Ну, раз про троллейбус пересечение вспомнили по Хмельницкого/Бабура, то нужно упомянуть ветку на Узбекский тракторный завод/Агрегатный по улице Уста-Ширин.

Про трамвайные написал, что не меньше 4, но их могло и больше быть. В первой половине 20 века и во 2 Мировую в частности, грузовых автомобилей почти не было, и не всё же на арбах возить? Тогда активно использовали трамваи и грузовые платформы к ним. И мы не знаем, где были грузовые трамвайные ветки, и где они могли пересекаться с железной дорогой.

В известной книге "Дорогами 20 века" только пара веток упоминается - на станцию "Кызыл Тукумачи" и на Заготзерно. Бог весть сколько ещё таких веток было.
И там говорится о просто огромном парке грузовых платформ для трамваев. Значит грузовое трамвайное движение было масштабным, и возили на платформах вовсе не перекупщиков с Куйлюка. Возили грузы от ж/д станций на различные предприятия и обратно.

Потом - иногда бывает, что железнодорожные пути прокладывают временно, для одной какой-то операции. Провезут по ней что нужно и разберут. Мы не знаем, были ли такие времянки. Поэтому я не стал писать, что с трамваем железная дорога пересекалась лишь в 4 местах. Их может быть больше. С троллейбусом-то всё ясно.